Timp de mai bine de 12 ani, Lia Bugnar a fost căsătorită cu scenaristul Dragoș Buhagiar, actualul președintele al UNITER (Uniunea teatrală din Romania), de care a divorțat în 2013. Ulterior, timp de aproximativ 9 ani, actrița a format un cuplu cu scenaristul, actorul și regizorul Anghel Damian, care formează în prezent un cuplu cu artista Theo Rose.